O ano de 1500 marca o início das grandes navegações comandadas principalmente por portugueses e espanhóis, e posteriormente ingleses, holandeses e franceses. A América recém descoberta por Colombo (1492), o estabelecimento do caminho para as Índias por Bartolomeu Dias e Vasco da Gama (entre 1488 e 1498), e a descoberta do Brasil (1500) marcam a história das extinções modernas. Com os europeus alcançando todos os cantos do mundo, a ciência prospera e iniciam-se as grandes descobertas do mundo animal. Juntamente vem a expansão, a colonização, a dispersão de ratos e animais domésticos, a agricultura, o desmatamento, a caça predatória, entre tantos outros fatores, que provocam várias extinções entre os animais recém descobertos principalmente na América e Austrália. Entretanto, com o passar dos anos, vários outros fatores, como a revolução industrial, o desenvolvimento de novas armas, novos métodos da pecuária e agricultura, culminaram em novas extinções, agora por todos os continentes. Esta é uma listagem de mamíferos que foram descritos pela ciência, mas foram extintos posteriormente. Todas as extinções aqui sofreram algum tipo de interferência provocada pelo homem.

Legenda:
Nome científico Autor, Ano – Nome popular em português (quando houver) – País ou Região – comentário sobre a extinção

Marsupiais
Caloprymnus campestris (Gould, 1843) – Austrália – não há registro desde 1935
Chaeropus ecaudatus (Ogilby, 1838) – Bandicoot-pés-de-porco – Austrália – o último espécime foi coletado em 1907, alguns registos visuais foram feitos na década de 1920, porém sem confirmação
Lagorchestes asomatus Finlayson, 1943 – Austrália – conhecido somente através de um crânio coletado em 1932
Lagorchestes leporides (Gould, 1841) – Austrália – o último registro foi em 1890
Macropus greyi Waterhouse, 1846 – Austrália – os últimos indivíduos na natureza foram registrados em 1924, animais em cativeiro sobreviveram até 1937
Macrotis leucura (Thomas, 1887) – Bandicoot-de-orelhas-de-coelho – Austrália – o último registro confirmado foi em 1931
Onychogalea lunata (Gould, 1841) – Austrália – extinto no início da década de 1960
Perameles eremiana Spencer, 1897 – Bandicoot-do-deserto – Austrália – o último exemplar foi coletado em 1943
Potorous platyops (Gould, 1844) – Austrália – extinto por volta de 1875
Thylacinus cynocephalus (Harris, 1808) – Lobo-da-tasmânia – Austrália – os últimos registros na natureza foram em 1930, o último exemplar em cativeiro morreu em 1936

Soricomorpha
Nesophontes micrus G. M. Allen, 1917 – Cuba
Nesophontes paramicrus Miller, 1929 – ilha de Hispaniola (Haiti)
Nesophontes zamicrus Miller, 1929 – ilha de Hispaniola (Haiti)
Nesophontes hypomicrus Miller, 1929 – ilha de Hispaniola (Haiti e República Dominicana)
Nesophontes edithae Anthony, 1916 – Porto Rico
Solendon marcanoi (Patterson, 1962) – Cuba
Todos foram descritos a partir de material sub-fóssil, entretanto estavam associados com restos de roedores dos gêneros Rattus e Mus, acreditando-se que tenham se extinguido com a chegada dos primeiros exploradores europeus

Rodentia
Crateromys paulus Musser e Gordon, 1981 – Filipinas – provavelmente extinto, conhecido apenas por um exemplar
Conilurus albipes (Lichtenstein, 1829) – Austrália – últimos registros na década de 1870
Leporillus apicalis (Gould, 1854) – Austrália – último exemplar coletado em 1933
Notomys macrotis Thomas, 1921 – Austrália – conhecido por dois espécimes coletados em 1843
Notomys mordax Thomas, 1922 – Austrália – único exemplar coletado em 1846
Notomys amplus Brazenor, 1936 – Austrália – espécie conhecida por dois exemplares coletados em 1896
Notomys longicaudatus (Gould, 1844) – Austrália – o último exemplar foi coletado em 1901
Pseudomys gouldii (Waterhouse, 1839) – Austrália – aparentemente extinto, nenhum exemplar foi coletado depois da década de 1850
Rattus macleari (Thomas, 1887) – ilha de Christmas – extinto entre 1901 1e1904
Rattus nativitatis (Thomas, 1889) – ilha Christmas – extinto em 1908
Uromys porculus Thomas, 1904 -1899, ilhas Salomão
Uromys imperator (Thomas, 1888) – 1960s ilhas Salomão
Peromyscus pembertoni Burt, 1932 – México – único exemplar coletado em 1932
Oryzomys nelsoni Merriam, 1898 – México – único exemplar coletado em 1897
Megaoryzomys curioi Niethammer, 1964 – ilhas de Galápagos – data de extinção desconhecida, mas acredita-se que extinguiu-se após a introdução de roedores do gênero Mus na ilha
Megalomys desmarestii (Fischer, 1829) – Martinica – extinto em 1903, devido a erupção do vulcão Pelee
Megalomys luciae (Forsyth-Major, 1901) – ilha de Santa Lúcia
Brotomys voratus Miller, 1916 – Hispaniola – data de extinção desconhecida, acredita-se que se extinguiu nos últimos 60 anos
Brotomys contractus Miller, 1929 – Haiti – extinto por volta de 1600
Boromys offella Miller, 1916 – Cuba – extinto por volta de 1870
Boromys torrei Allen, 1917 – Cuba – extinto por volta de 1870
Heteropsomys antillensis (Anthony, 1917) – Porto Rico – extinto por volta de 1750
Heteropsomys insulans Anthony, 1916 – Porto Rico – extinto por volta de 1550
Hexolobodon phenax Miller, 1929 – ilha de Hispaniola – extinto por volta de 1600
Isolobodon montanus (Miller, 1912) – ilha de Hispaniola – extinto por volta de 1500
Isolobodon portoricensis J.A.Allen, 1916 – Porto Rico – extinto por volta de 1500
Geocapromys thoracatus (True, 1888) – Ilha de Swan – extinto em 1955
Geocapromys columbianus (Fischer, 1829) – Cuba – extinto por volta de 1500
Rhizoplagiodontia lemkei Woods, 1989 – Haiti – data de extinção desconhecida
Quemisia gravis Miller, 1929 – ilha de Hispaniola – extinto por volta de 1700
Elasmadontomys obliquus Anthony, 1916 – Porto Rico – extinto por volta de 1500
Plagiodonta ipnaeum Johnson, 1948 – República Dominicana – data de extinção desconhecida

Lagomorpha
Prolagus sardus Wagner, 1832 – Sardenha e ilhas vizinhas – em 1774 ainda era abundante na ilha de Tavolara, acredita-se que extinguiu-se no final de 1700 ou início de 1800

Chiroptera
Phyllonycteris major Anthony, 1917 – Porto Rico – extinto por volta de 1500
Pteropus subniger (Kerr, 1792) – ilhas de Reunião e Maurício – em Maurício o ultimo exemplar coletado foi em 1859 e em Reunião foi em 1862, acredita-se que se extinguiram no decorrer da década de 1960
Pteropus pilosus Andersen, 1908 – Palau – conhecido somente por dois exemplares coletados em 1874
Pteropus loochoensis Gray, 1870 – Japão
Pteropus brunneus Dobson, 1878 – Austrália
Acerodon lucifer Elliot, 1896 – Filipinas – os últimos exemplares foram coletados em 1888 e 1892
Nyctimene sanctacrucis Troughton, 1931 – ilhas Salomão – o último registro foi em 1907 na ilha de Nendo
Nyctophilus howensis McKean, 1975 – ilha de Lord Howe – extinto por volta de 1500
Pipistrellus sturdeei Thomas, 1915 – Japão – conhecido por apenas um exemplar coletado em 1915
Pteropus tokudae Tate, 1934 – ilha de Guam – o último exemplar foi morto á tiros em 1968
Mystacina robusta Dwyer, 1962 – Nova Zelândia – extinto em 1988

Primatas
Daubentonia robusta – Madagascar – extinto em 1930

Carnivora
Dusicyon australis (Kerr, 1792) – Raposa-das-falkland – Ilhas Falkland (ou Malvinas) – o último espécime foi morto em 1876
Neovison macrodon Prentis, 1903 – Vison-marinho – América do Norte – extinto em 1860
Procyon gloveralleni Nelson e Goldman, 1930 – Barbados – o último animal vivo foi visto em 1964
Monachus tropicalis (Gray, 1850) – Foca-monge-das-caraíbas – Caribe – o último registro de uma colônia foi feito em 1952
Zalophus japonicus Peters, 1866 – Japão – extinto da década de 1950

Perissodactyla
Equus quagga Boddaert, 1785 – Quagga – África do Sul – o último exemplar morreu em 1883, na natureza acredita-se que tenham sobrevivido até 1878

Artiodactyla
Cervus schomburgki (Blyth, 1863) – Tailândia – o último exemplar morreu em cativeiro em 1938, na natureza extingui-se em 1932
Gazella arabica (Lichtenstein, 1827) – Gazela-árabe – Arábia Saudita – o único espécime conhecido foi coletado em 1825
Gazella rufina Thomas, 1894 – Gazela-vermelha – Argélia – extinta em 1894
Gazella bilkis Groves e Lay, 1985 – Iêmen – desde 1951 não foi mais observada na natureza e não existem exemplares em cativeiro
Hippotragus leucophaeus (Pallas, 1766) – Antílope-azul – África do Sul – o último exemplar foi morto em 1800

Cetacea
Lipotes vexillifer Miller, 1918 – Baiji – China – declarado extinto em 2006, entretanto poda haver exemplares ainda vivos

Sirenia
Hydrodamalis gigas (Zimmermann, 1780) – Dugongo-de-steller – Rússia – a última população foi vista em 1741, se tornando extinta em 1768

Lista de subspécies extintas

Marsupiais
Bettongia gaimardi gaimardi (Desmarest, 1822) – Austrália – extinto desde 1910
Bettongia lesueur graii (Gould, 1841) – Austrália – desapareceu na década de 1960
Bettongia penicillata penicillata Gray, 1843 – Austrália – extinta em 1923
Lagorchestes hirsutus hirsutus Gould, 1844 – Austrália – data de extinção desconhecida
Lagostrophus fasciatus albipilis (Gould, 1842) – Austrália – extinto desde 1906
Perameles bougainville fasciata Gray, 1841 – Austrália – desapareceu na década de 1930

Rodentia
Geomys pinetis goffi Sherman, 1944 – E.U.A. – o último registro foi feito em 1955
Nesoryzomys indefessus indefessus (Thomas, 1899) – ilhas Galápagos – último exemplar coletado em 1934
Oryzomys galapagoensis galapagoensis (Waterhouse, 1839) – ilhas Galápagos – não há registros desde a última coleta feita em 1835
Peromyscus gossypinus restrictus Howell, 1939 – E.U.A. – nenhum animal foi encontrado em expedições feitas em 1985
Peromyscus polionotus decoloratus Howell, 1939 – E.U.A. – extinto em 1946
Ratufa indica dealbata (Blanford, 1897) – Índia – extinto na década de 1940
Sigmodon arizonae arizonae Mearns, 1890 – E.U.A. – nenhum animal é coletado desde 1932
Sigmodon fulviventer goldmani Bailey, 1913 – E.U.A.
Synaptomys cooperi paludis Hibbard e Rinker, 1942 – E.U.A. – extinto em 1946
Synaptomys cooperi relictus Jones, 1958 – E.U.A. – extinto em 1968
Thomomys mazama tacomensis Taylor, 1919 – E.U.A. – o último espécime foi coletado em 1962

Primatas
Procolobus badius waldroni (Hayman, 1936) – Gana e Costa do Marfim – o último exemplar registrado foi em 1978, depois de inúmeras expedições em 1993 a 1999 ele foi declarado extinto em 2000

Carnivora
Panthera leo leo (Linnaeus, 1758) – Leão-do-atlas – norte da África – o último exemplar foi morto no Marrocos em 1942
Panthera leo melanochaitus (Smith, 1858) – Leão-do-cabo – África do Sul – os últimos animais foram mortos em 1865
Panthera tigris virgata (Illiger, 1815) – Tigre-do-cáspio – Ásia Central – o último animal foi morto em 1947, entretanto, registos visuais ocorreram até a década de 1970
Panthera tigris balica (Schwarz, 1912) – Tigre-de-bali – Bali, Indonésia – o último exemplar foi morto em setembro de 1937, registos na década de 1970 não foram confirmados
Panthera tigris sondaica (Temminck, 1844) – Tigre-de-java – Java, Indonésia – último animal registrado em 1979, extingui-se no início dos anos 80
Conepatus mesoleucus telmalestes Bailey, 1905 – E.U.A. – declarado extinto em 1994

Perissodactyla
Equus ferus ferus Boddaert, 1875 – Tarpan – Europa – os últimos exemplares selvagens foram mortos em 1814, o último em cativeiro morreu em 1879 na Ucrânia
Equus hemionus hemippus (Geoffroy, 1855) – Asno-sírio – Oriente Médio – o último exemplar em cativeiro morreu em 1927
Diceros bicornis longipes Zukowksy, 1949 – África Ocidental – possivelmente extinto, uma expedição em 2006 não encontrou nenhum animal
Dicerorhinus sumatrensis lasiotis (Buckland, 1872) – Índia, Bangladesh e Myanmar – considerado extinto, entretanto pode ter sobrevivido em Myanmar

Artiodactyla
Phacochoerus aethiopicus aethiopicus (Pallas, 1766) – África Oriental – extinto em 1900
Alcelaphus buselaphus buselaphus (Pallas, 1766) – norte da África – o último animal na natureza foi registrado em 1925 em Marrocos, em cativeiro o último exemplar morreu na França em 1923
Bison bonasus caucasicus Turkin e Satunin, 1904 – Montes Cáucasos – o último exemplar puro em cativeiro morreu em 1925, na natureza os três últimos animais foram mortos em 1927, hoje só restam animais cruzados
Bison bonasus hunganorum Kretzoi, 1946 – Cárpatos – o último exemplar morreu em 1790
Bos primigenius primigenius (Bojanus, 1927) – Auroque – Europa – o último exemplar morreu na Polônia em 1627
Capra pyrenaica pyrenaica Schinz, 1838 – Cabra-dos-pirineus – Espanha – o último exemplar morreu em 6 de janeiro de 2000
Capra pyrenaica lusitanica – Cabra-do-Gerês – Portugal – o último exemplar em cativeiro morreu na Espanha em 1890 e na natureza a última aparição foi em 1892 na Serra do Gerês
Kobus leche robertsi Rothschild, 1907 – Zâmbia – extinto em 1994
Orebia ourebi kenyae Meinhertzhagen, 1905 – Quênia – extinto em 1996